Koh Ker è situata tra le pendici meridionali dei monti Dangrek, i monti Kulen (Phnom Kulen) a sud-ovest e il monte Tbeng (Phnom Tbeng, vicino a Tbeng Meanchey) a est. La maggior parte del terreno collinare è coperta dalla giungla, ma la maggior parte degli alberi perdono le foglie stagionalmente. Nella seconda parte del 19° secolo, mentre i ricercatori e gli avventurieri francesi si aggiravano nelle foreste intorno al sito di Koh Ker, la popolazione di selvaggina era impressionante. La città di Koh Ker è stata attraversata dalla via strategica più importante dell'impero Khmer. Venendo da Angkor e Beng Mealea a Koh Ker, questa strada portava a Prasat Preah Vihear e da lì a Phimai in Thailandia e Wat Phu in Laos.[1](pp13–14) La regione di Koh Ker è relativamente secca. Numerose cisterne e canali furono costruiti durante il IX e il X secolo per assicurare l'approvvigionamento idrico. Oggigiorno l'acqua viene pompata da una profondità di 30-40 metri (da 98 a 131 piedi) metri